水肥一體機的應用就是為了滿足農作物水肥充足且不浪費。因而，運用滴灌系統和低壓管道系統將農作物成長所需要的水溶液逐漸均勻地滴進農作物的根區，運用高頻滴灌設備將少許的肥水慢慢地施用到農作物的根莖，使農作物自始至終保持最佳的肥水條件下。防止其余灌水方式導致水的過分飲用或營養不良。

因而，與常用溝灌相比較，滴灌在土壤溫度、肥水分布范圍、鹽份運移等領域具有明顯差距。淺水、施肥和膜間鹽份積累增加了農作物根莖在近地表的分布范圍和成長，抑止了農作物根莖的往下成長。根莖是農作物吸取營養和水份的最主要部位。根莖的特征構造影響了根莖的取水能力。

因而，根的確定是防止適量澆肥的第一步。確定根莖的最主要方式有兩種：挖掘(挖掘剖面以觀察土壤中的根莖)和直接觀察：應用專業設備掃描根莖分布范圍、營養的空間和范圍以及與相鄰根莖的資源競爭力。土壤含水量減少的最主要原因是農作物蒸騰和樹間蒸發。農作物的蒸騰量很大。此時農作物根莖吸水，夜間土壤含水量迅速下降。水肥一體化，在滿足作物水肥供應的同時，避免了水資源的浪費和化肥污染。土壤含水量變化與根莖成長的關系，即有吸水的地方就有根莖;因而，農作物根莖的成長可以通過不同深度的土壤含水量來判斷。

在確定根莖分布范圍深度后，控制灌溉深度是防止過分灌溉的第二步。相對含水量可以直接反映灌溉的初始含水量，通常用于判斷是否需要灌溉和計算灌溉量。根據含水量確定灌溉量的方式最主要有兩種：經驗(根據種植者自身的經驗來判斷土壤水分和作物是否需要施肥，然后進行人工施肥灌溉)和設備(根據根莖分布范圍特征，將水份監測設備埋入土壤中控制灌溉設備的啟動和結束)。

總之，滴灌和施肥只能用于灌溉和施肥根莖。因而，有必要了解農作物根莖分布范圍的深度，然后根據根莖分布范圍和濕潤鋒土壤的分布范圍特征來控制單次灌溉量。